A Região Hidrográfica Amazônica é a maior do País e dispõe de uma extensão de mais de15.000 km, representando cerca de 60% da rede hidroviária nacional. Compreende as hidrovias do Amazonas, do Solimões, do Madeira, do Negro e Branco, do Purus, do Juruá,do Tapajós, do Trombetas, do Xingu, do Marajó e de muitos outros rios navegados e de menor porte. Tem como principais características a movimentação de petróleo e derivados,o transporte de granéis sólidos (grãos e minérios), de carga geral e de passageiros.
Desempenha alta função social de abastecimento e comunicação das comunidades ribeirinhas e de manutenção da brasilidade.
Bacia Amazônica: Rio Amazonas, Rio Jari, Rio Xingu, Rio Paru, Rio apajós, Rio Juruema, Rio Arinos, Rio Teles Pires, Rio Trombetas, Rio Uatumã, Rio Madeira,Rio Mamoré, Rio Guaporé, Rio Negro, Rio Branco, Rio Solimões, Rio Purus, Rio Acre, Rio Japurá, Rio Iça, Rio Juruá, Rio Envira, RioTarauacá.
Bacia do Tocantins: Rio Tocantins, Rio Araguaia, Rio Itacaiúnas, Rio das Mortes, Rio Javaés.
Bacia do Nordeste: Rio Parnaíba, Rio das Balsas.
Bacia do São Francisco: Rio São Francisco, Rio Paracatu, Rio Grande, Rio Corrente
Bacia do Paraná: Rio Paraná, Rio Amambaí,Rio Ivaí, Rio Ivinheima, Rio Paranapanema, Rio Tibagi, RioPardo, Rio Sucuriú, Rio Tietê, Rio Piracicaba, Rio São José dos Dourados, Rio Grande, Rio Paranaíba.
Bacia do Paraguai: Rio Paraguai, Rio Miranda, Rio Taquari, Rio São Lourenço, Rio Cuiabá.
Bacia do Atlântico Sul: Rio Jacuí, Rio Taquari, Rio Caí, Rio dos Sinos, Rio Gravataí, Lago Guaíba, Lagoa dos Patos, Rio Camaquã Canal de São Gonçalo, Lagoa mirim, Rio Jaguarão.
Bacia do Uruguai: Rio Uruguai, Rio Ibicuí, Rio Chapecó.
